微波加热技术己逐渐成为一种新型的医疗废物处理技术，已经应用于小批量、间隙式的处理医疗废物，满足大批量、连续式处理医疗废物的要求微波处理装置一直在持续开发过程中。微波（消毒）处理技术具有如下特点：
(1)节能
微波加热具有独到之处。其他加热方式都是先加热物体表面，然后热量由表面传到内部；而微波则可对物体内部进行直接加热，且加热均匀、无能量损失、 能量损失、能量高，处理物品时 ，穿透性强，瞬时即可穿透到物体内部。
(2)作用温度低
在产生等量热效应的前提下，微波作用到物体上的温度要明显低于普通加热。普通加热杀菌所需温度在120℃以上，作用20min；而微波杀菌温度为70℃～105℃，作用1.5～5min。
微波杀毒是微波热效应和生物效应共同作用的结果，在一定强度微波场的作用下，菌体会因含有极化分子吸收微波能升温，从而使蛋白质变形，失去生物活性，快速杀菌。微波消毒技术不产生和恶臭气体，无废水排放。
焚烧工艺较适合规模较大的医疗废物处置，30t/d以上的医疗废物处置往往采用回转窑焚烧等技术。小规模医疗废物焚烧设施（如3t/d、5t/d），虽然其所有工艺环节（如尾气急冷、脱酸、袋滤等）都与大规模焚烧设施类似，但实现达标排放有较大的难度。一是需要配置要求的焚烧尾气在线监测装置等设施，投资大；二是小规模焚烧设施来料不稳定，难以实现稳定连续运行，对尾气处理工艺造成的波动较大，在频繁的起炉和停炉间歇过程中存在污染，维持燃烧需要的辅助燃料成本极高，实现达标排放难。高温蒸汽、微波、化学和高温干热等技术因具有可以间歇运行、运行费用低、适应性强、二次污染少、不产生等污染物、易于操作管理、运行效果稳定等优点，比较适用于小规模的医疗废物处理处置。
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